Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TubP50586 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TubP50586 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TubP50586 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TubP50586 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TubP50586 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TubP50586 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TubP50586 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TubP50586 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TubP50586 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TubP50586 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TubP50586 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TubP50586 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TubP50586 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TubP50586 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TubP50586 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TubP50586 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TubP50586 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TubP50586 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TubP50586 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TubP50586 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms