Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SftpdP50404 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SftpdP50404 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SftpdP50404 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SftpdP50404 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SftpdP50404 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms