Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl5P50228 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl5P50228 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms