Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc3P49135 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms