Protein–RNA interactions for Protein: P48776

Tdo2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdo2P48776 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdo2P48776 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdo2P48776 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdo2P48776 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdo2P48776 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdo2P48776 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdo2P48776 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdo2P48776 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdo2P48776 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms