Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptx3P48759 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms