Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gli1P47806 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gli1P47806 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gli1P47806 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms