Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrprbP47758 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms