Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnr1P47746 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnr1P47746 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms