Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax9P47242 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms