Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11bP46638 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms