Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc2P43407 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc2P43407 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms