Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms