Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtgfrP43117 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtgfrP43117 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms