Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-2P42586 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-2P42586 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms