Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp9P41245 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp9P41245 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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