Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tjp1P39447 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tjp1P39447 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms