Protein–RNA interactions for Protein: P35803

Gpm6b, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpm6bP35803 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gpm6bP35803 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpm6bP35803 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms