Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ly6dP35459 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6dP35459 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms