Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hes1P35428 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hes1P35428 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hes1P35428 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hes1P35428 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms