Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn11P35235 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptpn11P35235 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn11P35235 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms