Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd28P31041 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms