Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VtnP29788 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VtnP29788 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VtnP29788 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VtnP29788 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VtnP29788 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VtnP29788 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VtnP29788 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VtnP29788 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VtnP29788 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VtnP29788 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VtnP29788 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VtnP29788 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VtnP29788 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VtnP29788 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms