Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OatP29758 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OatP29758 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OatP29758 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OatP29758 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OatP29758 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OatP29758 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OatP29758 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OatP29758 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OatP29758 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OatP29758 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OatP29758 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OatP29758 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OatP29758 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OatP29758 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OatP29758 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OatP29758 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OatP29758 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OatP29758 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OatP29758 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OatP29758 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OatP29758 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OatP29758 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OatP29758 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OatP29758 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OatP29758 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OatP29758 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms