Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprmP28828 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprmP28828 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprmP28828 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprmP28828 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprmP28828 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprmP28828 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprmP28828 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprmP28828 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprmP28828 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprmP28828 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprmP28828 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprmP28828 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprmP28828 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms