Protein–RNA interactions for Protein: P28740

Kif2a, Kinesin-like protein KIF2A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif2aP28740 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Kif2aP28740 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif2aP28740 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms