Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc6a9P28571 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms