Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd10P28359 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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