Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb3P28231 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms