Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6aP27664 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms