Protein–RNA interactions for Protein: P27546

Map4, Microtubule-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map4P27546 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Map4P27546 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Map4P27546 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Map4P27546 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map4P27546 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Map4P27546 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map4P27546 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map4P27546 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map4P27546 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Map4P27546 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Map4P27546 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Map4P27546 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map4P27546 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map4P27546 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map4P27546 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map4P27546 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map4P27546 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map4P27546 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map4P27546 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map4P27546 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map4P27546 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Map4P27546 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map4P27546 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map4P27546 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map4P27546 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map4P27546 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Map4P27546 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map4P27546 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map4P27546 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Map4P27546 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Map4P27546 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map4P27546 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map4P27546 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map4P27546 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map4P27546 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map4P27546 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map4P27546 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Map4P27546 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map4P27546 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map4P27546 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Map4P27546 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map4P27546 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map4P27546 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map4P27546 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map4P27546 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map4P27546 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map4P27546 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 520.8 ms