Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarsP26638 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarsP26638 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarsP26638 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarsP26638 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SarsP26638 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarsP26638 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarsP26638 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarsP26638 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SarsP26638 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SarsP26638 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SarsP26638 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarsP26638 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarsP26638 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarsP26638 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SarsP26638 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SarsP26638 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarsP26638 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarsP26638 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarsP26638 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarsP26638 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarsP26638 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SarsP26638 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SarsP26638 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SarsP26638 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SarsP26638 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SarsP26638 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SarsP26638 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms