Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CftrP26361 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CftrP26361 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CftrP26361 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CftrP26361 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CftrP26361 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CftrP26361 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CftrP26361 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CftrP26361 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CftrP26361 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CftrP26361 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CftrP26361 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CftrP26361 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CftrP26361 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CftrP26361 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CftrP26361 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CftrP26361 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CftrP26361 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CftrP26361 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CftrP26361 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CftrP26361 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CftrP26361 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CftrP26361 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CftrP26361 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CftrP26361 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CftrP26361 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CftrP26361 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CftrP26361 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CftrP26361 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CftrP26361 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CftrP26361 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CftrP26361 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CftrP26361 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CftrP26361 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CftrP26361 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CftrP26361 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CftrP26361 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CftrP26361 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CftrP26361 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CftrP26361 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CftrP26361 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CftrP26361 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CftrP26361 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CftrP26361 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CftrP26361 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CftrP26361 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CftrP26361 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CftrP26361 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CftrP26361 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CftrP26361 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CftrP26361 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CftrP26361 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CftrP26361 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CftrP26361 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CftrP26361 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CftrP26361 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CftrP26361 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CftrP26361 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CftrP26361 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CftrP26361 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CftrP26361 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CftrP26361 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CftrP26361 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CftrP26361 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms