Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdk11bP24788 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk11bP24788 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms