Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd12P23812 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd12P23812 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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