Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZfaP23607 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZfaP23607 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZfaP23607 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZfaP23607 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZfaP23607 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZfaP23607 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms