Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggta1P23336 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms