Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkchP23298 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkchP23298 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkchP23298 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkchP23298 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkchP23298 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkchP23298 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkchP23298 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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