Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tap1P21958 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tap1P21958 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tap1P21958 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms