Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pou3f1P21952 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou3f1P21952 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou3f1P21952 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms