Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myo5bP21271 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Myo5bP21271 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms