Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klra1P20937 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klra1P20937 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms