Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnc2P20801 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc2P20801 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms