Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prim1P20664 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prim1P20664 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prim1P20664 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms