Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fcer1aP20489 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fcer1aP20489 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms