Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NefhP19246 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NefhP19246 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NefhP19246 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NefhP19246 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NefhP19246 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NefhP19246 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NefhP19246 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NefhP19246 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NefhP19246 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NefhP19246 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NefhP19246 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NefhP19246 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NefhP19246 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NefhP19246 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NefhP19246 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NefhP19246 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefhP19246 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefhP19246 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefhP19246 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefhP19246 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NefhP19246 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefhP19246 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefhP19246 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefhP19246 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms