Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb1P17919 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb1P17919 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms