Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tph1P17532 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tph1P17532 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tph1P17532 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tph1P17532 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tph1P17532 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms