Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhbP16125 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LdhbP16125 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LdhbP16125 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhbP16125 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhbP16125 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdhbP16125 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms