Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp53P15975 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp53P15975 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp53P15975 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp53P15975 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp53P15975 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms