Protein–RNA interactions for Protein: P11881

Itpr1, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr1P11881 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itpr1P11881 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itpr1P11881 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itpr1P11881 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itpr1P11881 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itpr1P11881 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms